More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3673 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  87.37 
 
 		 190 aa  332  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  76.84 
 
 		 191 aa  286  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  71.89 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  71.35 
 
 		 188 aa  257  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  69.68 
 
 		 190 aa  256  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  70.43 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  66.67 
 
 		 189 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  67.96 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  67.4 
 
 		 194 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  67.4 
 
 		 189 aa  232  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.57 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  45.76 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  49.44 
 
 		 190 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  44.86 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  42.05 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  42.77 
 
 		 204 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  38.76 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  38.59 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  38.67 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 239 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 239 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 243 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 		 247 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  39.43 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  36.08 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  34.35 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 240 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 240 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  36.26 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.36 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  38.46 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.65 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  35.71 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  31.89 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 212 aa  85.1  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.69 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.26 
 
 		 213 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  31.52 
 
 		 202 aa  84.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  31.69 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  31.69 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  31.69 
 
 		 203 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  31.69 
 
 		 203 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  31.69 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  31.69 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  31.52 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  31.52 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  35.64 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.05 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.78 
 
 		 427 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  31.15 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  30.98 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.51 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.97 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.96 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.32 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  31.32 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.17 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  34.52 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>