More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3949 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
232 aa  460  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 
237 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.49 
 
 
427 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
208 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 
440 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.26 
 
 
411 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  34.42 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.68 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.68 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.68 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  28.02 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  28.02 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.33 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  27.05 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  27.54 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  27.54 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  27.54 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  27.54 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.7 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.23 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.38 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 
591 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.56 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  39.35 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.8 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.96 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  32.4 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  27.8 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33.95 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.75 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  32 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.68 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.89 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.14 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  31.96 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  34.53 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.57 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>