More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0234 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 181 aa  361  4e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  72.88 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  44.3 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  43.51 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  42.42 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  43.67 
 
 		 210 aa  100  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  43.64 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 206 aa  94.4  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.1 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.82 
 
 		 227 aa  89  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 200 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  42.96 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  43.61 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.27 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  40.38 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.71 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.71 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 214 aa  85.1  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 		 224 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  39.75 
 
 		 217 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  42.57 
 
 		 198 aa  84.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 220 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 209 aa  84.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 220 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  38.27 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.85 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  37.65 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  38.27 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  38.27 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  42.07 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  41.04 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  36.05 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  39.74 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  40.52 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  33.54 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  37.65 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  39.61 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  40.76 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  41.22 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  40.4 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.43 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  40.4 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  41.06 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  36.05 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  35.67 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  41.94 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>