More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1570 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
198 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  66.49 
 
 
193 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  61.54 
 
 
195 aa  235  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  60 
 
 
223 aa  227  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  57.65 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  58.25 
 
 
193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  57.14 
 
 
200 aa  197  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 
191 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 
194 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  64.38 
 
 
178 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  55.1 
 
 
190 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  56.25 
 
 
200 aa  178  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  48.5 
 
 
238 aa  177  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  51.55 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  50.26 
 
 
194 aa  171  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  49.74 
 
 
194 aa  168  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  48.99 
 
 
193 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  50.77 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  46.39 
 
 
196 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  47.45 
 
 
200 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  51.79 
 
 
195 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  51.52 
 
 
198 aa  157  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  49.01 
 
 
215 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  50.51 
 
 
193 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  39.37 
 
 
234 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  42.4 
 
 
237 aa  148  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  45.11 
 
 
210 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  48.7 
 
 
240 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  47.76 
 
 
202 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  44.67 
 
 
227 aa  141  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  44.67 
 
 
203 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  44.67 
 
 
203 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  43.65 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  44.16 
 
 
203 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  40.78 
 
 
236 aa  133  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  42.7 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 
244 aa  121  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  37.22 
 
 
239 aa  118  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 
201 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  38.58 
 
 
201 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 
206 aa  104  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.33 
 
 
442 aa  94.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.29 
 
 
442 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.17 
 
 
227 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  36.7 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.37 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
226 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.75 
 
 
213 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
226 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.33 
 
 
442 aa  87.8  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.75 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
207 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.66 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  34.12 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  43.2 
 
 
228 aa  85.1  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.57 
 
 
443 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.81 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  40.4 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.9 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  35.64 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.16 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.16 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 
229 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  41.04 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>