More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2516 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  65.64 
 
 		 195 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  66.49 
 
 		 198 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  61.54 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  58.12 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  56.54 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  53.4 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  54.87 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  52.6 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  55.96 
 
 		 193 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  53.93 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  55.79 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 203 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  52.36 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  52.26 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  49.47 
 
 		 194 aa  175  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  50 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  48.4 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  62.12 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  53.4 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  51.61 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  44.1 
 
 		 238 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  47.62 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  40.27 
 
 		 234 aa  153  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  43.81 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  48.42 
 
 		 240 aa  148  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  48.74 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  45.11 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  45.36 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  48.26 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  46.45 
 
 		 203 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  46.45 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  46.45 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  40.55 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  43.17 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  40.62 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  38.89 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  35.19 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  40.94 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  38.15 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 452 aa  89.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.95 
 
 		 378 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 214 aa  84.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  31.63 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  43.12 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.45 
 
 		 378 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  31.12 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 449 aa  81.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  31.12 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.5 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.12 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  31.12 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  31.12 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  31.12 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  33.85 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 459 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  30.61 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.46 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 389 aa  77.8  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.31 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  32.6 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  32.6 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 445 aa  74.7  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.16 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  32.04 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  32.04 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>