More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2260 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  84.73 
 
 		 203 aa  336  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  59.69 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  59.49 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  57.95 
 
 		 195 aa  208  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  57.14 
 
 		 198 aa  197  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  54.87 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  54.97 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  49.19 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  54.26 
 
 		 194 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  45.85 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  52.38 
 
 		 190 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  47.37 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  49.47 
 
 		 193 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  48.65 
 
 		 189 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  48.4 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  48.74 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  48.66 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  47.16 
 
 		 200 aa  148  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  58.57 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  46.02 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  41.84 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 194 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  46.41 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  46.41 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  46.41 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  43.24 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  45.21 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  45.26 
 
 		 240 aa  137  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  41.81 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  42.63 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  42.05 
 
 		 228 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  35.75 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  39.67 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  39.91 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  36.7 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  36.87 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  45.28 
 
 		 159 aa  89  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  42.96 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.44 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.44 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.85 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  38.57 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.67 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 370 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.56 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 440 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.26 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.69 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.77 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  31.31 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.57 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>