More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2126 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  68.78 
 
 		 193 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  67.2 
 
 		 193 aa  255  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  52.69 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  52.97 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  54.01 
 
 		 191 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  53.4 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  52.08 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  52.41 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  50.52 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  50.51 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 		 200 aa  170  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  50.26 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  45.45 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  43.85 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  48.7 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  50.52 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  46.56 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  41.23 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  47.31 
 
 		 206 aa  150  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  46.11 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  40.32 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  41.36 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  44.67 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  38.22 
 
 		 234 aa  137  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  46.34 
 
 		 215 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  40.86 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  41.57 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  40.88 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  44.27 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 244 aa  117  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  33.93 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  55.38 
 
 		 178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  41.01 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  41.01 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  41.01 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  38.18 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  39.11 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  38.18 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  55.77 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  41.54 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.81 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.27 
 
 		 442 aa  74.7  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.73 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.72 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.32 
 
 		 442 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.22 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.11 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.67 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  37.41 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.22 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.22 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  47.31 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.59 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  25.25 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.74 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.71 
 
 		 443 aa  64.7  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.06 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  31.29 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 445 aa  64.7  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.75 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>