More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14910 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
240 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  46.63 
 
 
191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  48.44 
 
 
195 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  48.42 
 
 
193 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 
223 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  46.32 
 
 
203 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  47.12 
 
 
193 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  48.7 
 
 
198 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  46.07 
 
 
198 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  47.37 
 
 
194 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  45.26 
 
 
200 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  46.7 
 
 
200 aa  135  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  42.33 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  41.13 
 
 
238 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  48.02 
 
 
215 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  40.21 
 
 
196 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 
200 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  43.54 
 
 
212 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 
194 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  53.38 
 
 
178 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  43.46 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 
194 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  44.39 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  40.21 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  36.54 
 
 
234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  44.27 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  38.58 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  45.69 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  45.18 
 
 
203 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  45.18 
 
 
203 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  39.27 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  39.89 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  35.14 
 
 
237 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  42.41 
 
 
228 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  36.24 
 
 
236 aa  104  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
244 aa  99  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  34.36 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  38.86 
 
 
195 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 
206 aa  95.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  40.4 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.83 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  40 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  31.41 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.61 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.31 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.44 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.15 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.5 
 
 
382 aa  68.9  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  38 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.95 
 
 
442 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.03 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.13 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.13 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  35 
 
 
197 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
447 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
207 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.38 
 
 
365 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.38 
 
 
365 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.38 
 
 
365 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.74 
 
 
442 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
199 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.02 
 
 
444 aa  62  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  31.78 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
448 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 
205 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
448 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.04 
 
 
442 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  32.41 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.54 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
452 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>