More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89865 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  45.45 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  40.61 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 191 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 189 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  36.2 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 193 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  35.41 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 193 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 		 193 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 195 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 190 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 194 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  33.63 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  33.94 
 
 		 203 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  33.94 
 
 		 203 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  33.94 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 203 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  30.33 
 
 		 196 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 		 194 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  30.32 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  28.63 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  31.11 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  31.6 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 215 aa  99  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  29.81 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  32.23 
 
 		 206 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  30.21 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  28.51 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  30.2 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  29.44 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  32.5 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.78 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  30.73 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  26.86 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  27.66 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  27.23 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  24.4 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  25.45 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  25.45 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  29.51 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  23.96 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  27.27 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  24.56 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.28 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  30.05 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  28.96 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  26.67 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  24.88 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  24.19 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.27 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  26.91 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  30.6 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  25.37 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  25.37 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  25.37 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  23.94 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  25.88 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  24.39 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  33.03 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>