More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1113 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  48.6 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  46.35 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  50.77 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  45.31 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  51.61 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  49.21 
 
 		 202 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  45.08 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  46.35 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  48.9 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  46.35 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  46.35 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  47.34 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  49.19 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  47.57 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  52.25 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  45.25 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  50.28 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  47.37 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  45.99 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  46.02 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 194 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  40.72 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  44.51 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  45.71 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  47.31 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  40.33 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  34.8 
 
 		 234 aa  130  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  43.26 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  43.01 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  41.53 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  42.7 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  53.44 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  39.69 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  37.8 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  37.02 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.33 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.72 
 
 		 442 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  42.76 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.76 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.12 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.54 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.65 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  40.52 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.34 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.22 
 
 		 442 aa  68.2  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.17 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.17 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.74 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  36.14 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.58 
 
 		 442 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>