More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2693 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  44.1 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  41.41 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  40.41 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 		 261 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 242 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  31.02 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 224 aa  91.3  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  31.98 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  31.63 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  30.41 
 
 		 236 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 440 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  30.1 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.85 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.82 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  29.69 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 389 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 275 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0651  phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00089207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.65 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.65 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  29.56 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.65 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.04 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.81 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.77 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.28 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  27.64 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  28 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.26 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  24.38 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>