More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1642 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  48.15 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  47.62 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  47.62 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  45.6 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  41.94 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  46.89 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  40.32 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  44.51 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  40.21 
 
 		 195 aa  134  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 		 238 aa  130  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  45.18 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  41.23 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  42.94 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  42.94 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  39.57 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  38.07 
 
 		 239 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  41.99 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  37.23 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.33 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  42.78 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  41.04 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  40.94 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  39.31 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  49.24 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  34.66 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  34.66 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  33.18 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  38.61 
 
 		 240 aa  95.1  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  33.49 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  32.23 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 251 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 411 aa  68.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.21 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.21 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.93 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.75 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.07 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.1 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  31.1 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  38.85 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.72 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  28.96 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  25.66 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  25.11 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  24.67 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  31.79 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.19 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>