More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_09371 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  64.71 
 
 
210 aa  248  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  49.47 
 
 
190 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  51.6 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  49.19 
 
 
200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  48.35 
 
 
191 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
193 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  46.49 
 
 
203 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  49.48 
 
 
223 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  45.41 
 
 
189 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  45.95 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  46.52 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  47.06 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  46.39 
 
 
198 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 
194 aa  160  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  46.07 
 
 
195 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  45.11 
 
 
194 aa  158  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 
202 aa  154  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  47.45 
 
 
200 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  45.25 
 
 
206 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 
238 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  45.26 
 
 
193 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  43.68 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  43.68 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  43.85 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  42.55 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  42.02 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  42.02 
 
 
203 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  41.3 
 
 
227 aa  141  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  38.02 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  39.13 
 
 
203 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  37.7 
 
 
228 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  32.85 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  40.21 
 
 
240 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  37.04 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
215 aa  117  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  44.85 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 
244 aa  106  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  32.72 
 
 
237 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 
220 aa  92  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 
206 aa  92  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.34 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.93 
 
 
205 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
209 aa  88.2  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  32.57 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  32.02 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
225 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  32 
 
 
203 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 
213 aa  84.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  31.43 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  36.73 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  33.14 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.99 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  32.02 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.38 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  32.57 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
370 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  32 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  27.69 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  32 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  31.17 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.43 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>