More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3403 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  100 
 
 
188 aa  370  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  72.88 
 
 
181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  44.65 
 
 
237 aa  101  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.75 
 
 
205 aa  92  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  41.51 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  42.21 
 
 
192 aa  87  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  36.73 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.66 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.09 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  43.29 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.52 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.52 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.5 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  41.54 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  40.76 
 
 
225 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 
222 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.36 
 
 
222 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  40.94 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  38.57 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  35.8 
 
 
217 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  40 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  38.04 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  38.04 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  34.01 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  37.8 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  36.81 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  45.16 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  37.42 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  35.03 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  43 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  37.27 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  43 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  37.75 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.48 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  35.03 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  35.03 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  35.03 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>