More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0587 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 183 aa  357  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  40.72 
 
 		 208 aa  94.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 227 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  92  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 212 aa  91.3  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  43.29 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 224 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  41.82 
 
 		 237 aa  89  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 220 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.46 
 
 		 222 aa  87.4  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 222 aa  87.4  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 221 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 221 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  39.31 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 240 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 215 aa  85.5  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  36.26 
 
 		 229 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 218 aa  85.1  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 212 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 223 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 218 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  36.26 
 
 		 220 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  36.26 
 
 		 220 aa  85.1  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.24 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 233 aa  84.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  38.26 
 
 		 226 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.26 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  35.67 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  35.84 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  29.51 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.95 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  41.14 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.42 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.25 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 226 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 226 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 226 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  39.01 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  37.1 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  45.56 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  39.16 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.41 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.81 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.18 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>