More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4661 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 185 aa  364  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  46.36 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  42 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 194 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  40.4 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.13 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  38.51 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  40.32 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  45.36 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  36.18 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.23 
 
 		 547 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.44 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 447 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.54 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.47 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.84 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  39.45 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.03 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.78 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.06 
 
 		 448 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.11 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  37.34 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  27.81 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>