168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2366 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  370  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  39.26 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  27.85 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  37.34 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1112  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.27 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.855452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1293  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.54 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  33.51 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.62 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.75 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.7 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  31.61 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  35.37 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.11 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.11 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.3 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  34.35 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  24.28 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  32 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 402 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.65 
 
 		 378 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  30.3 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  23.98 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  26.24 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.69 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  32.93 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  25.9 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 215 aa  45.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  23.6 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 253 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>