261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2980 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  58.33 
 
 		 193 aa  217  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  55.08 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  51.08 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  55.61 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  55.61 
 
 		 192 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  32.68 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.04 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 262 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 251 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  32.16 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  31.58 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  31.58 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.3 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  31.58 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  27.65 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 412 aa  61.6  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.59 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  30.86 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  30.43 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.95 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  30.95 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  30.95 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  30.95 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  30.95 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  30.95 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  31.75 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.47 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.88 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  35.34 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  34.25 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  32.43 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  26.39 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  39.04 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 182 aa  51.6  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.21 
 
 		 378 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 370 aa  51.2  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>