More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2208 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  68.37 
 
 		 196 aa  285  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  66.84 
 
 		 196 aa  278  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  54.59 
 
 		 194 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  51.02 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  51.02 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  50 
 
 		 194 aa  170  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  49.23 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  52.55 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  46.5 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  46.5 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  46.5 
 
 		 616 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  46.5 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  46.5 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  46.5 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  46.5 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  46.23 
 
 		 196 aa  151  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48.72 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  40.91 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.33 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  37.93 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  37.36 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 184 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  40.88 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.18 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.18 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  33.15 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.08 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  38.51 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.25 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  35.37 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.2 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  32.07 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  32.07 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  31.97 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  34.93 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.08 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  34.09 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  35.42 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  26.29 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  32.12 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.61 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 440 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  34.76 
 
 		 177 aa  62  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  28.92 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.03 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  26.5 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.97 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  30.53 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>