More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2783 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  58.29 
 
 		 196 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  50 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  50 
 
 		 192 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  46.88 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  45.71 
 
 		 616 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  45.71 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  45.71 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  45.71 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  45.71 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  45.71 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  45.71 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  43.15 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  37.5 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  37.36 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 196 aa  98.2  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  41.42 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  42.01 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  42.01 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  44.71 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  42.24 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  46.15 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  42.01 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 182 aa  84.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.26 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  38.06 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  29.78 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.98 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.14 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  37.98 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  37.98 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.99 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.07 
 
 		 411 aa  61.6  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  23.86 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  24.63 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  29.94 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.09 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.05 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.14 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.14 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  23.31 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  24.57 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.86 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.38 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  31.54 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 591 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.08 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  34.13 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  38.66 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>