More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2288 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 155 aa  322  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  46.98 
 
 		 591 aa  158  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  52.78 
 
 		 201 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  48.3 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  45.95 
 
 		 256 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  45.83 
 
 		 241 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  42.18 
 
 		 223 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  42.28 
 
 		 213 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  44.03 
 
 		 198 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  36.73 
 
 		 217 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  36.91 
 
 		 200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 202 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 200 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  35.57 
 
 		 198 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  35.57 
 
 		 198 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 214 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 210 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 201 aa  94  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  37.86 
 
 		 193 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 		 208 aa  91.3  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.57 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3550  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.03 
 
 		 316 aa  87.8  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.78 
 
 		 201 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 207 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 205 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 447 aa  81.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.7 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.57 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  28.19 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  28.19 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  34.88 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  28.19 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.89 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 449 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  28.19 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  28.19 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 401 aa  77.8  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.41 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 366 aa  77.4  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 216 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  34.88 
 
 		 194 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.3 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.53 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27.89 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.06 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.66 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.62 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 459 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 448 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  30.87 
 
 		 440 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.08 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.08 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  28.08 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.21 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.08 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 447 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.35 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 448 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 445 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.4 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.4 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.12 
 
 		 442 aa  70.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32 
 
 		 207 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 213 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 218 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.4 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.53 
 
 		 382 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.43 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  24.34 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>