More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0433 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  49.26 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  41.55 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  42.18 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.6 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.49 
 
 		 212 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 191 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  32.99 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 412 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  40.52 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.37 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.58 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.19 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.05 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  30.88 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  24.14 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.4 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  34.3 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  28.95 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.67 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  24.86 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  24.86 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.61 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  35.19 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.62 
 
 		 427 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  31.37 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  30.37 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  28.06 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>