More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1249 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  54.82 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  54.08 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  43.65 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  43.63 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  45.95 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  44.94 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  41.71 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  38.5 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  37.3 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  37.91 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.76 
 
 		 190 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  36.41 
 
 		 189 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  37.85 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  37.29 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  41.01 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  38.07 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  37.36 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  33.96 
 
 		 213 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  34.44 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.9 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.16 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 370 aa  88.6  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.73 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  36.69 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 247 aa  88.2  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 448 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  29.35 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 445 aa  85.9  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.51 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.97 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.65 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.28 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  32.48 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  34.04 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  34.04 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  34.04 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  34.04 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  34.04 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  34.04 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 448 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 253 aa  81.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.22 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  32.2 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  33.57 
 
 		 616 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  35.25 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  31.16 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 449 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  26.84 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.31 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.96 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  25.85 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  28.02 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 459 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  30.63 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 447 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>