164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1193 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
616 aa  1077    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
199 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
199 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
199 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 
199 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 
199 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 
199 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  78.61 
 
 
196 aa  259  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  55.56 
 
 
194 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  55.56 
 
 
194 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  55.56 
 
 
194 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  56.28 
 
 
195 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  55.05 
 
 
194 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  56.57 
 
 
194 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  53.77 
 
 
194 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48 
 
 
196 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  47.5 
 
 
196 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  46.5 
 
 
196 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  43.75 
 
 
192 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  45.71 
 
 
195 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  42.86 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  44 
 
 
192 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 
191 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.78 
 
 
196 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
177 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
177 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.08 
 
 
185 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  44.52 
 
 
194 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 
174 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  40.57 
 
 
184 aa  89  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
202 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 
179 aa  87.4  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 
182 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 
183 aa  77.8  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.53 
 
 
207 aa  75.1  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
208 aa  73.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  38.85 
 
 
198 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 
181 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  30.65 
 
 
197 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
256 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
182 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
200 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 
183 aa  63.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  36.62 
 
 
216 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 
203 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  35.66 
 
 
208 aa  60.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
207 aa  60.8  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.12 
 
 
200 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.12 
 
 
200 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.14 
 
 
217 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 
247 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
204 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 
215 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
200 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 
204 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 
196 aa  58.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.06 
 
 
201 aa  57.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.76 
 
 
200 aa  57.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  35.17 
 
 
193 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  37.4 
 
 
201 aa  57.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 
203 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  34.86 
 
 
204 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
235 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
378 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.1 
 
 
188 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  33.54 
 
 
198 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
216 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.45 
 
 
196 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.1 
 
 
190 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
195 aa  55.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  37.23 
 
 
194 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 
200 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 
188 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
202 aa  55.1  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
208 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  35.81 
 
 
194 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
200 aa  54.3  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.41 
 
 
198 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
190 aa  53.9  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 
202 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  39.81 
 
 
183 aa  53.5  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
200 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  39.35 
 
 
199 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.28 
 
 
197 aa  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  36.89 
 
 
277 aa  52.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.81 
 
 
191 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.41 
 
 
427 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.11 
 
 
190 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
215 aa  51.6  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  33.59 
 
 
188 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
591 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40 
 
 
189 aa  50.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
193 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  26.14 
 
 
210 aa  50.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 
179 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  38.79 
 
 
196 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>