More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1026 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 182 aa  380  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  39.74 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.77 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  35.15 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  34.73 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  35.29 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  35.53 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  35.77 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.09 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  32.9 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  32.9 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  32.9 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  32.9 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  32.9 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  32.9 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  32.68 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  32.9 
 
 		 616 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  29.67 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  29.2 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.14 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  32.05 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.07 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  31.87 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 389 aa  65.1  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  35.95 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.58 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  37.07 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.82 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 211 aa  62  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  30.67 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  37.3 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.65 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.33 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.33 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  31.48 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.3 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  28.8 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.92 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>