More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0151 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  44.09 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  42.54 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  45.56 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  42.53 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  40.33 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.78 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  39.11 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  44.3 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.16 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  42.24 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  37.95 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  40.62 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  42.95 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  42.58 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 203 aa  94.7  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  41.57 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  38.93 
 
 		 204 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  42.31 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  42.31 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  42.31 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  42.31 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  42.31 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  42.31 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  42.31 
 
 		 616 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  45.86 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  45.86 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  44.87 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  45.06 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.79 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  43.59 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  37.93 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  43.95 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  42.07 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  35.2 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  33.15 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  34.08 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  38.89 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  36.64 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  39.84 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  37.3 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 		 412 aa  65.1  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.34 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  29.76 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.35 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  31.91 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.17 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.17 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  36.3 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  35.53 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  37.04 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>