More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2499 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 194 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  93.81 
 
 		 194 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  82.47 
 
 		 194 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  82.47 
 
 		 194 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  81.96 
 
 		 194 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  82.9 
 
 		 194 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  72.02 
 
 		 195 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  54.59 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  55.05 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  55.05 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  55.05 
 
 		 616 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  55.05 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  55.05 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  55.05 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  55.05 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  52.04 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  51.02 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  56.85 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  45.93 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  45.35 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  44.19 
 
 		 192 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  37.16 
 
 		 179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  44.71 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.87 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 177 aa  95.9  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  41.14 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  41.83 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  41.01 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  44.16 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.12 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.12 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.52 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.91 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 247 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  30.19 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.74 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.53 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  34.97 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  35.06 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  34.48 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.22 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.65 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.67 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  38.4 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  35.46 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.01 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  34.86 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  36.36 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  30.49 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  34.78 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.17 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.16 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  34.44 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  31.65 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  22.56 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>