155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0927 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  60.44 
 
 
200 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  59.67 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  55.8 
 
 
203 aa  182  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  49.72 
 
 
184 aa  161  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  50.84 
 
 
182 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  48.63 
 
 
183 aa  148  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  47.75 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.56 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
177 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  39.35 
 
 
191 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 
216 aa  98.2  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
174 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  37.5 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  40.12 
 
 
192 aa  87.8  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  37.29 
 
 
196 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 
195 aa  87.8  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  45.1 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  37.29 
 
 
196 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  45.1 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  45.1 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  45.1 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  45.1 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  45.1 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  42.2 
 
 
616 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 
177 aa  87  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  40.46 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.85 
 
 
196 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  46.1 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.51 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  38.85 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  36.05 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  33.76 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  42.75 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  45.33 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  43.71 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  43.71 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  32.14 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  44.16 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  41.56 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  41.06 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 
197 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  31.82 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  38.53 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
402 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.71 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 
215 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  23.46 
 
 
209 aa  54.7  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.37 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  36.94 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.55 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.53 
 
 
442 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.82 
 
 
442 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.37 
 
 
442 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
370 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  35.51 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.47 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  31.93 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  36.89 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  28.75 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 
252 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.12 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  27.67 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.55 
 
 
222 aa  47.8  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
222 aa  47.8  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 
412 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
245 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.58 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40.35 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  36.08 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 
247 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  34.97 
 
 
194 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 
188 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  35.24 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>