More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0454 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  58.33 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  50.79 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  49.74 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  49.21 
 
 		 192 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 262 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 		 251 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 251 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 229 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 249 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.34 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 240 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.89 
 
 		 213 aa  84.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  32.18 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 370 aa  74.7  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.83 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.83 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.83 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.83 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.83 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.83 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  30.77 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38 
 
 		 452 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  30.22 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.03 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.84 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  29.83 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.67 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  28.92 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  28.42 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.23 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.12 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  29.12 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.78 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.63 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.12 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.12 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  26.53 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.22 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.22 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.22 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.97 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.11 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  25.65 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  31.48 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.41 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 		 391 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 412 aa  61.6  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  26.53 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.29 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>