More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0423 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  59.72 
 
 		 217 aa  261  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  34.27 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1109  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.782275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1293  phosphoglycerate mutase family protein  27.4 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  36.25 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1112  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.5 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.855452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.53 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  36.53 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  38.75 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  28.83 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.75 
 
 		 382 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  37.82 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  37.34 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  37.5 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.74 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  26.78 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  41.23 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.56 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.58 
 
 		 452 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.59 
 
 		 378 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.4 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.81 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  26.97 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25.32 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.98 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  26.38 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  34.91 
 
 		 383 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  26.38 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.9 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  33.53 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  31.9 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  25.58 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  25.58 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.75 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  33.73 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.48 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.94 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.48 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.48 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>