More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1112 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1112  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  100 
 
 		 214 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.855452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1293  phosphoglycerate mutase family protein  95.79 
 
 		 214 aa  361  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1109  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.782275  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  27.92 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 194 aa  101  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  27.71 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.21 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.55 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.85 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.89 
 
 		 442 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  29.56 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  25.64 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.5 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  25.5 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  24.62 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  25.5 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  25.5 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  25.64 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  25.64 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  25.5 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  25.64 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  25.64 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.53 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  24.5 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  26.05 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.98 
 
 		 442 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  24.5 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  27.17 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.63 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.91 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.65 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  28.99 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  24.52 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  24.19 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  25.6 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.49 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  22.44 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  29.7 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  29.7 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  22.75 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.5 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.22 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  25.14 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  26.7 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.22 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.22 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  28.57 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  25.29 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  25.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  26.16 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  21.9 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  28.41 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  26.41 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  25.29 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  25.6 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  27.43 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  25.37 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  26.71 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.5 
 
 		 442 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  27.01 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  26.44 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  22.41 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>