More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33040 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  100 
 
 		 189 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  67.4 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  72.78 
 
 		 194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  73.33 
 
 		 194 aa  240  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  67.58 
 
 		 191 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  70.29 
 
 		 188 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  68.72 
 
 		 190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  69.14 
 
 		 188 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  63.54 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  66.67 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  68.57 
 
 		 188 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  43.55 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  46.63 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  49.46 
 
 		 206 aa  160  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.02 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  46.45 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  49.43 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  43.5 
 
 		 196 aa  140  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  43.45 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  43.12 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  38.07 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  41.11 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  43.09 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  36.42 
 
 		 213 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  34.07 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  45.12 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 241 aa  101  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 247 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 243 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 240 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 235 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 240 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  34.54 
 
 		 240 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  38.33 
 
 		 224 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  35.98 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  32.32 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.95 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  32.95 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  32.95 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.69 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  32.95 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  32.95 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.15 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.15 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  33.53 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.46 
 
 		 213 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  39.41 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  33.53 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  32.95 
 
 		 203 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.37 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  32.02 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.33 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.37 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  31.64 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  31.64 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.96 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  31.64 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  34.08 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.72 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 363 aa  74.7  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  25.45 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>