More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0112 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
234 aa  457  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  68.72 
 
 
230 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  65.22 
 
 
230 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  71.63 
 
 
235 aa  290  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  62.66 
 
 
242 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  70.04 
 
 
235 aa  288  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  60.1 
 
 
236 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  55.97 
 
 
245 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  53.68 
 
 
234 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  56.36 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  55.27 
 
 
238 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  57.67 
 
 
235 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 
221 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  50.43 
 
 
234 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  55.31 
 
 
228 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  49.79 
 
 
224 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  49.17 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  50.64 
 
 
245 aa  198  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  50.93 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  51.6 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  51.44 
 
 
261 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  50.25 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  51.74 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  52.22 
 
 
242 aa  184  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  51.38 
 
 
238 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  51.38 
 
 
238 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  51.38 
 
 
238 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  51.85 
 
 
233 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  48.89 
 
 
273 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 
241 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  43.84 
 
 
245 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  42.27 
 
 
230 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
204 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 
198 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 
199 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 
199 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 
201 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 
445 aa  92.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.58 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
447 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
214 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 
200 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 
213 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 
402 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.2 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
207 aa  79  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 
448 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.17 
 
 
378 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 
448 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  35.77 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  35.77 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.87 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.7 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.2 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.58 
 
 
442 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.74 
 
 
442 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  37.76 
 
 
194 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
221 aa  72  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.13 
 
 
444 aa  71.6  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.32 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.06 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.86 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.65 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.7 
 
 
443 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.46 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.5 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>