More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1169 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  57.6 
 
 
233 aa  255  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  58.06 
 
 
275 aa  254  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  55.66 
 
 
233 aa  246  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.16 
 
 
235 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  55.25 
 
 
234 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  53.91 
 
 
274 aa  232  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  51.53 
 
 
245 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  52.75 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  54.34 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  56.46 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  48.93 
 
 
273 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  50.89 
 
 
245 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  52.36 
 
 
242 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  49.79 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  52.97 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  47.75 
 
 
235 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  49.75 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  51.49 
 
 
236 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 
230 aa  185  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  52.68 
 
 
230 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  49.55 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  49.55 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  49.55 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  48.51 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  45.24 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  48.6 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 
223 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  46.6 
 
 
235 aa  161  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 
230 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  43.22 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  42.71 
 
 
245 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 
199 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 
204 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
204 aa  111  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  41.85 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
200 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 
207 aa  98.2  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
213 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 
440 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.87 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  34.48 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33 
 
 
427 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.85 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.9 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  33 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
401 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.35 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.51 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  32.02 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.6 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
412 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  34.38 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>