More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2283 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
245 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  69.16 
 
 
233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  67.65 
 
 
235 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  62.18 
 
 
233 aa  278  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  64.95 
 
 
233 aa  262  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  59.73 
 
 
275 aa  255  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  55.42 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  64.11 
 
 
236 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  59.53 
 
 
245 aa  248  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  56.28 
 
 
234 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  56.65 
 
 
273 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  51.53 
 
 
224 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  55.61 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  51.49 
 
 
234 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  59.31 
 
 
235 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  56.67 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  54.98 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  50.42 
 
 
242 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  53.78 
 
 
242 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  57.56 
 
 
238 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  57.56 
 
 
238 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  57.56 
 
 
238 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  54.74 
 
 
230 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  52 
 
 
221 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  50.64 
 
 
234 aa  198  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  48.93 
 
 
261 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  48.72 
 
 
230 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 
230 aa  184  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  51.5 
 
 
235 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  51.01 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 
230 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
223 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  41.81 
 
 
245 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  40.97 
 
 
241 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 
199 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
204 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
213 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 
207 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 
209 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
213 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 
200 aa  99  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
214 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
208 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.65 
 
 
205 aa  92.4  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 
204 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
201 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
206 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 
213 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
211 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
200 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.39 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.39 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.39 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.67 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.73 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
411 aa  77  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.18 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.65 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 
427 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.62 
 
 
196 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.94 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.37 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  25.62 
 
 
203 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.11 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.15 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.11 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>