More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0238 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  42.16 
 
 		 223 aa  174  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  41 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  39 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  38.66 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  38.02 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 275 aa  118  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  38.66 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.06 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 233 aa  99.4  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  37.88 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  34.52 
 
 		 235 aa  95.9  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  36.27 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  34.34 
 
 		 236 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 261 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 234 aa  88.2  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  29.18 
 
 		 261 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  29.18 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.65 
 
 		 427 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.84 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  36.1 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 402 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 412 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.52 
 
 		 442 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.67 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.89 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.2 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  26.5 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  34.57 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.21 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.42 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.42 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>