More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1313 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  68.97 
 
 		 204 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  66.5 
 
 		 201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  52.49 
 
 		 261 aa  231  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  52.11 
 
 		 261 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  51.01 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  47.74 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  41.54 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 273 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  41.36 
 
 		 261 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  38.92 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.14 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 245 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 242 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  37.26 
 
 		 275 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  39.34 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 		 230 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 		 234 aa  97.1  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  39.04 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 245 aa  87.8  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 238 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 238 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 238 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  32.43 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  37.37 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.83 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  34.3 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.53 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.41 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  35.18 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 411 aa  72.4  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  38 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 412 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  37.18 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.66 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  36.42 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  37.5 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.75 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  40.56 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.84 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.45 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.84 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.84 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.17 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>