More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2165 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  83.9 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  64.88 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  61.14 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  56.79 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  59.66 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  56.25 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  59.35 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  60.18 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  52.81 
 
 		 234 aa  235  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  59.23 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  55.27 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  53.16 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  54.5 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  57.42 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  52.67 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  56.12 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  56.12 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  56.12 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  55.07 
 
 		 230 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  51.26 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  52.38 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  55.7 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  57.84 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  46.1 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  47.75 
 
 		 224 aa  208  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  53.25 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  47.93 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  49.79 
 
 		 261 aa  201  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  55.02 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  41.51 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  38.66 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.52 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.73 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.37 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.6 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 370 aa  75.5  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 447 aa  75.1  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.4 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.34 
 
 		 442 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.53 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.87 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.32 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.36 
 
 		 444 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  24.64 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 459 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 412 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.5 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.5 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.35 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.48 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>