More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12165 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  71.73 
 
 		 234 aa  339  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  71.73 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  71.73 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  71.73 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  70.89 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  63.55 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  53.81 
 
 		 221 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  58.25 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  54.62 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  57.35 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  55.61 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  53.66 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  56.37 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  53.62 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  55.98 
 
 		 261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  51.96 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  54.19 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  50.98 
 
 		 242 aa  201  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  51.92 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  46.06 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  48.06 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  50.7 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  48.24 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  51.28 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  50.25 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  47.39 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  46.78 
 
 		 273 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  51.24 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  49.75 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 204 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.19 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 370 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 199 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.37 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.27 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.27 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.72 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.27 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 212 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 212 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  25.25 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  25.25 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.57 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.29 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  25.64 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  27.17 
 
 		 180 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.6 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  23.44 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>