More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0181 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.26 
 
 		 369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.07 
 
 		 356 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 370 aa  98.6  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.4 
 
 		 378 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.1 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.6 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.52 
 
 		 365 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.52 
 
 		 365 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.52 
 
 		 365 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.89 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 363 aa  88.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 452 aa  88.6  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.93 
 
 		 382 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  30.51 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.23 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 445 aa  85.5  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.23 
 
 		 378 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  31.52 
 
 		 383 aa  84.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  23.2 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  23.2 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  24.39 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  23.2 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.11 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.95 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.27 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  27.62 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.05 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.27 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>