More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2319 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  86.34 
 
 		 235 aa  357  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  64.02 
 
 		 233 aa  278  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  60.34 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  57.38 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  56.68 
 
 		 245 aa  244  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  57.5 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  57.94 
 
 		 236 aa  234  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  54.58 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  58.05 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  56.54 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  51.95 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  59.72 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  51.9 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  53.78 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  53.78 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  53.78 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  52 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  49.12 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  53.18 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  49.79 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  51.29 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  54 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  45.9 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  53.16 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  56.59 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  46.34 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  54.76 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  45.9 
 
 		 261 aa  191  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  48.73 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  39.91 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.25 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.24 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 199 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.01 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.52 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.6 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.59 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.16 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.16 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.16 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.36 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.4 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  28.5 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.95 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.67 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.15 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.35 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.12 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.29 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.71 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.4 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.17 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.32 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>