More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  81.22 
 
 		 230 aa  374  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  78.6 
 
 		 230 aa  362  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  70.04 
 
 		 234 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  75.81 
 
 		 235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  64.46 
 
 		 242 aa  291  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  52.79 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  59.5 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  54.29 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  57.21 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  53.56 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  55.46 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  49.14 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  53.16 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  57.62 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  51.5 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  46.37 
 
 		 274 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  52.19 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  49.75 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  48.57 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  48.54 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  48.6 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  51.94 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  51.94 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  51.94 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  45.76 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  47.78 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  46.7 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  47.19 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  38.57 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  39.52 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  40.76 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 411 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.05 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 402 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.53 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.98 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.08 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.05 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 447 aa  75.1  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.65 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.52 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.59 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.51 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.51 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.51 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  25.49 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  33.99 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.56 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.27 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.52 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 445 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.61 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  31.53 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>