More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0260 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 207 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 234 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  36.04 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  38.31 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 		 261 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  40.41 
 
 		 242 aa  104  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  42.02 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.22 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  36.32 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 274 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  40.11 
 
 		 412 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 236 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 402 aa  95.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 245 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 411 aa  94.7  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 230 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  40.76 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 440 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  29.85 
 
 		 236 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.81 
 
 		 378 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.61 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.82 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.81 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  33.11 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.47 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  38.25 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.36 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.65 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.5 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 412 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.26 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.26 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.26 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  27.95 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.32 
 
 		 427 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.69 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.15 
 
 		 442 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  38.41 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.63 
 
 		 442 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.71 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>