269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0053 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  87.94 
 
 		 200 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  79.4 
 
 		 202 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  79.4 
 
 		 202 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  79.4 
 
 		 202 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  62.31 
 
 		 209 aa  241  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  62.76 
 
 		 215 aa  238  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  61.93 
 
 		 208 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  59.6 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  62.81 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  58.79 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  57 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  63.82 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.5 
 
 		 212 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  59.16 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  59 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  58.08 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  54.81 
 
 		 226 aa  214  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  59.2 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  58.91 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  55.78 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  51.5 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  53.81 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  56.78 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  54.55 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  52.74 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  54.27 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  53.61 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  57.36 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  53.69 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  55.61 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  48.33 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  51.28 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  46.98 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  40.2 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  34.78 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.16 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.16 
 
 		 356 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.29 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 440 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  45.24 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.12 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.12 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.12 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  32.12 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  31.77 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  27.43 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  31.96 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  45.21 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.53 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  29.82 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 412 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.12 
 
 		 365 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.12 
 
 		 365 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.12 
 
 		 365 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 391 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 370 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 389 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0909  Phosphoglycerate mutase  41.1 
 
 		 171 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.223074  hitchhiker  0.000993193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>