More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0688 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  78.74 
 
 		 208 aa  338  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  72.73 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  73.08 
 
 		 212 aa  312  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  68.69 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  61.43 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  62.5 
 
 		 214 aa  251  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  62.81 
 
 		 215 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  63.64 
 
 		 202 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  63.64 
 
 		 202 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  63.64 
 
 		 202 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  60.77 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  57.69 
 
 		 229 aa  245  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  61.31 
 
 		 217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  59.15 
 
 		 218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  58 
 
 		 208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.25 
 
 		 212 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  60.7 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  63.64 
 
 		 200 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  62.31 
 
 		 211 aa  241  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  57.58 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  61.11 
 
 		 217 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  58.42 
 
 		 216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  55.84 
 
 		 226 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  58.33 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  55.33 
 
 		 214 aa  224  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  51.23 
 
 		 211 aa  224  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  51.18 
 
 		 211 aa  224  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  58.79 
 
 		 258 aa  223  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  53.49 
 
 		 221 aa  216  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  53.18 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  53.66 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  53.73 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  51.2 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  41.55 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  38.26 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.17 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  47.56 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  46.34 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  28.22 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.24 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  37.86 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  37.86 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.12 
 
 		 365 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  26.9 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.12 
 
 		 365 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.12 
 
 		 365 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  46.97 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.5 
 
 		 369 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>