More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36168 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  100 
 
 
340 aa  706    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.43 
 
 
442 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.05 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.85 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
209 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.64 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  28.64 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.57 
 
 
444 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.98 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  29.9 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  30.39 
 
 
194 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.91 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 
214 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.76 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.85 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.94 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.6 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
213 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.53 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.94 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 
448 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 
207 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.26 
 
 
201 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.26 
 
 
201 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
207 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  25.74 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  31.02 
 
 
189 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.46 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  26.94 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
214 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  30.41 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.29 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.77 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 
223 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  30.62 
 
 
401 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
201 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 
448 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
228 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 
207 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
198 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  29.84 
 
 
190 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
200 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 
440 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
198 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
199 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 
220 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.8 
 
 
240 aa  63.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
190 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
233 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
220 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
220 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
190 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
235 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
212 aa  62.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.73 
 
 
356 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
242 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
223 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
209 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
197 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
188 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.51 
 
 
198 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 
198 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.6 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 
217 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  29.41 
 
 
188 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
197 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
222 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.38 
 
 
222 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28 
 
 
378 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>