216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6718 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  72.73 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  74.52 
 
 		 212 aa  316  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  68.45 
 
 		 208 aa  295  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  60.48 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  64.68 
 
 		 215 aa  256  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  65.17 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  59.35 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  62.44 
 
 		 202 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  62.31 
 
 		 217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  57.89 
 
 		 223 aa  239  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  56.06 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  60.1 
 
 		 217 aa  237  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  57.62 
 
 		 218 aa  237  8e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  55.72 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  56.06 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  61.26 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  55.29 
 
 		 229 aa  228  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 		 202 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  56.28 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  53.85 
 
 		 212 aa  227  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  54.42 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  58.79 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  58.33 
 
 		 258 aa  224  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  52.73 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  54.95 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  57.58 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  51.67 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  55.72 
 
 		 215 aa  211  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  50.25 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  56.22 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  53.14 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  52.17 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  39.63 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  37.44 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  44.58 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.29 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  28.33 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  41.46 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  42.68 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  37.76 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 236 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.25 
 
 		 369 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.73 
 
 		 383 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  39.74 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  42.17 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.48 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0909  Phosphoglycerate mutase  41.11 
 
 		 171 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.223074  hitchhiker  0.000993193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.65 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.84 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  46.97 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 370 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 440 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>