169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3255 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  61.01 
 
 		 214 aa  245  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  62.9 
 
 		 218 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  58.6 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  59.52 
 
 		 230 aa  236  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  60.28 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  58.41 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  60.1 
 
 		 208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  52.65 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  57.28 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  55.77 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  56.37 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  53.66 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  51.89 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  53.14 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  56.28 
 
 		 215 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  58.06 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  58.54 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  49.34 
 
 		 226 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  53.3 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  56.68 
 
 		 211 aa  201  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  52.53 
 
 		 215 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  54.68 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  54.73 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  54.73 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  54.73 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  57 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  51.66 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  52.53 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  52.25 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  53.69 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  51.96 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  52.22 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  49.3 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  51.17 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  39.46 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  36.28 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  32.67 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.83 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  45.35 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  34.72 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  38.37 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 412 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  46.99 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.38 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  40.26 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  52.38 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  49.32 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 411 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.82 
 
 		 369 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  40.23 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  38.78 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>