207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0627 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  61.14 
 
 		 214 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  58.05 
 
 		 217 aa  251  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  61.24 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  57.62 
 
 		 258 aa  242  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  56.44 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  57.82 
 
 		 214 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  60.28 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  60.93 
 
 		 218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  56.06 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  57.21 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  59.05 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  55.33 
 
 		 209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  54.55 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  58.11 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  54.07 
 
 		 211 aa  222  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  57.21 
 
 		 216 aa  222  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  55.12 
 
 		 217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  56 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  53.77 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  52.83 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  52.88 
 
 		 215 aa  215  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  55.84 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  53.51 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  58.88 
 
 		 202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  55.56 
 
 		 212 aa  211  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  55.22 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  54.68 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  54.87 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 211 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  52.86 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  52.28 
 
 		 200 aa  201  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  55.9 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  51.28 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  51.28 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  51.28 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  38.64 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  36.89 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  47.76 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  27.86 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  41.1 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.58 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  43.94 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  22.42 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.72 
 
 		 369 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  37.61 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.03 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  32.67 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.71 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.37 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  45.68 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.91 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  43.94 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.91 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  34.78 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.71 
 
 		 442 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0909  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.223074  hitchhiker  0.000993193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>