223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4519 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  94.44 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  65.74 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  61.81 
 
 		 209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  60.7 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  62.38 
 
 		 212 aa  250  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  64 
 
 		 223 aa  247  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  58.02 
 
 		 209 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  56.68 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  54.37 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  63.4 
 
 		 202 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  63.4 
 
 		 202 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  63.4 
 
 		 202 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  58.29 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  61.42 
 
 		 202 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  60.55 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  61.22 
 
 		 200 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  57.35 
 
 		 214 aa  237  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  59.9 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  60.2 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 230 aa  234  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  57.21 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  55.14 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  57.35 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  56.28 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  55 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  55.87 
 
 		 215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  52.74 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  51.43 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  49.1 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  52.91 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  55.71 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  47.58 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  52.51 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  36.7 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  35.43 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.96 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  33.11 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.62 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.08 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  35.71 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.63 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.08 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  26.56 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  26.56 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.74 
 
 		 383 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.46 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.21 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.56 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  33.13 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.18 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 440 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.26 
 
 		 365 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.26 
 
 		 365 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 412 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.26 
 
 		 365 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.01 
 
 		 427 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  25.41 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 363 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 391 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.52 
 
 		 382 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  34.48 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>